[变异毒株]C.1.2,南非新晋毒王
关于C.1.2这货,刚好咱还是有点发言权的…
7月13日,深圳CDC上传了这个毒株的测序记录,
——请品鉴:
(顺便吐句槽啊,当初深圳市WJW多次号称6月份约堡飞深圳那架CA868航班上那30多个感染者全是Delta,却暗搓搓地把C.1.2的测序记录上传GISAID,简直捉摸不透…)
害,还出了个不大不小的糗……
然而,身为第一事故现场的南非,当时本土都好几十例了,还跟无事发生一样,就尼玛离谱……
三、茫茫多的突变
根据英格兰卫生署道友们的资料,咱一眼就看得出来,C.1.2这货的突变程度明显要高于同辈,
——请品鉴:
↑ 如上图,黄色高亮部分是C.1.2的演化树,距离圆心越远,则代表与原始株的差异程度(divergence)越大。
——或者咱换成南非卫生部的图看起来更清楚:
这也就是为啥当初《观网》要说C.1.2“突变速率是Delta的两倍”(错误的说法!)
因为这货的突变位点真的很夸张。
四、免疫逃逸界新晋扛把子
话说这周新鲜出炉了一篇预印本,
——请品鉴:
标题:
使用各种疫苗接种产生的抗体(部分接种者曾有既往感染史)对C.1.2和Mu变异毒株的中和试验
——一句话总结,试验结果如下:
带有C.1.2刺突蛋白的假病毒,对中和抗体的抵抗力强于所有VOC。
↑ 上图从左到右四个突变分别是康复者血清、BNT疫苗接种后产生的抗体、Moderna疫苗接种后产生的抗体,以及强生疫苗接种后产生的抗体。
每个图表的纵轴是半数最大中和滴度(IC50),横轴则是各个毒株(B.1、Beta、Delta、额外加了N501S突变的Delta、Mu以及C.1.2)。
试验结果一目了然:针对康复者血清以及三种疫苗,C.1.2相对B.1的IC50降幅如下:
康复者血清下降7.8倍; BNT疫苗下降7.3倍; moderna疫苗下降8.8倍; 强生疫苗下降15.7倍。
上一代扛把子Mu的战绩分别为4.7倍、6.8倍、5.8倍和8.8倍;
上上一代扛把子Beta的战绩则是4.4倍、4.8倍、3.9倍和7.6倍。
↑ 以上是比利时鲁汶大学Tom Wenseleers老师的南非各毒株流行率相对增长率多项式曲线拟合模型。
根据截止7月底的数据,在Delta已然占据当地主流毒株地位的情况下,C.1.2流行率相对增长率仅比Delta低每天2%~
考虑到置信区间的话,谁快谁慢都还两说……
或者横向比较的话,当初以增速迅猛出名的Mu,在主场哥伦比亚,流行率相对增长率比Delta低每天10%……
并且吧,事实往往比预想的更糟糕~
没想到当初预测Delta走势一举成功的Wenseleers老师,这一回也失手了……
C.1.2在南非的实际增长率,是这样的~
——请品鉴:
↑ 以上蓝色曲线是以采样日期(即核酸检测日期)计算的流行率增长曲线(2021年3月起,截止2021年9月底);橘色曲线则是以提交日期(即把测序结果上传到GISAID数据库的日期)计算的流行率增长曲线(2021年6月起,截止2021年10月23日)
由于南非测序和上传工作效率感人,所以这两条曲线略有差别,
但不管哪一条,都在切切实实地增长。